Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC162PA2VCL2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC162PA2VCL2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC162PA2VCL2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC162PA2VCL2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms