Protein–RNA interactions for Protein: A0A578

TCRBV5S1A1T, T-cell receptor beta variable 5-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBV5S1A1TA0A578 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCRBV5S1A1TA0A578 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCRBV5S1A1TA0A578 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCRBV5S1A1TA0A578 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCRBV5S1A1TA0A578 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
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