Protein–RNA interactions for Protein: W5XKT8

SPACA6, Sperm acrosome membrane-associated protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA6W5XKT8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPACA6W5XKT8 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms