Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNX8Q9Y5X2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX8Q9Y5X2 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms