Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRAPPC8Q9Y2L5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms