Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSX2IPQ9Y2D8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms