Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LIPT1Q9Y234 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LIPT1Q9Y234 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms