Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MBD1Q9UIS9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MBD1Q9UIS9 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms