Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms