Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5BQ9UGL1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5BQ9UGL1 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms