Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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DUX4Q9UBX2 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
DUX4Q9UBX2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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