Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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