Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DBF4Q9UBU7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DBF4Q9UBU7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms