Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TFIP11Q9UBB9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TFIP11Q9UBB9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms