Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARHGAP28Q9P2N2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms