Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC180Q9P1Z9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms