Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NKIRAS2Q9NYR9 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms