Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POLR1EQ9GZS1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms