Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCGF6Q9BYE7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms