Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BBS2Q9BXC9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms