Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAGR1Q9BTK6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAGR1Q9BTK6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms