Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCMBPQ9BTE3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms