Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NICN1Q9BSH3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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