Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBF4Q9BQW3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms