Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
RETNLBQ9BQ08 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GSE1-201ENST00000253458 7495 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
RETNLBQ9BQ08 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms