Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GPA33Q99795 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms