Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PIK3R4Q99570 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms