Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX18Q96RF0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms