Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARXQ96QS3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms