Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ANKRD27Q96NW4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ANKRD27Q96NW4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms