Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HIC2Q96JB3 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms