Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BICD1Q96G01 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
BICD1Q96G01 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms