Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC97Q96F63 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCDC97Q96F63 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms