Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RNFT2Q96EX2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms