Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SNX21Q969T3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SNX21Q969T3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms