Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RFKQ969G6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms