Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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USP9XQ93008 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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USP9XQ93008 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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USP9XQ93008 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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USP9XQ93008 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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USP9XQ93008 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
USP9XQ93008 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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USP9XQ93008 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP9XQ93008 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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USP9XQ93008 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
USP9XQ93008 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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