Protein–RNA interactions for Protein: Q92743

HTRA1, Serine protease HTRA1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA1Q92743 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HTRA1Q92743 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTRA1Q92743 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms