Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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RABGGTAQ92696 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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