Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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ZNF548Q8NEK5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ZNF548Q8NEK5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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