Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEG2

C7orf57, Uncharacterized protein C7orf57, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf57Q8NEG2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
C7orf57Q8NEG2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms