Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
AVL9Q8NBF6 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms