Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD53Q8N9V6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD53Q8N9V6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms