Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LINC00612Q8N6U2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms