Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LTBP4Q8N2S1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LTBP4Q8N2S1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms