Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
BHLHA9Q7RTU4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms