Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SV2AQ7L0J3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms