Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms