Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM198BQ6UWH4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms