Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms